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Este teste utiliza a sonda de MLPA da MRC-Holland SALSA MLPA P245 Microdeletion Syndromes-1A para a análise das seguintes doenças:
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SÃndrome |
Locus genético |
OMIM |
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SÃndrome de deleção 1p36 |
1p36 |
607872 |
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SÃndrome de microdeleção 2p16.1-p15 |
2p16.1-p15 |
612513 |
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SÃndrome de microdeleção / microduplicação 2q23.1 |
2q23.1 |
156200 |
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SÃndrome de GLASS |
2q32-q33 |
612313 |
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SÃndrome de microdeleção 3q29 |
3q29 |
609425 |
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SÃndrome de microduplicação 3q29 |
3q29 |
611936 |
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SÃndrome de Wolf-Hirschhorn |
4p16.3 |
194190 |
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SÃndrome do Cri-du-Chat |
5p15 |
123450 |
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SÃndrome de Sotos |
5q35.3 |
117550 |
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SÃndrome de Williams-Beuren |
7q11.23 |
194050 |
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SÃndrome de duplicação de Williams-Beuren |
7q11.23 |
609757 |
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SÃndrome de Langer-Giedion |
8q24.11-q24.13 |
150230 |
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SÃndrome de microdeleção 9q22.3 |
9q22.3 |
- |
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SÃndrome de DiGeorge região 2 |
10p13-p14 |
601362 |
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SÃndrome de Prader-Willi |
15q11.2 |
176270 |
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SÃndrome de Angelman |
15q11.2 |
105830 |
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SÃndrome de microdeleção de Witteveen-Kolk * / 15q24 |
15q24 |
613406 |
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SÃndrome de Rubinstein-Taybi |
16p13.3 |
180849 |
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SÃndrome de Miller-Dieker |
17p13.3 |
247200 |
|
Lissencefalia do tipo 1 |
17p13.3 |
607432 |
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SÃndrome de Smith-Magenis |
17p11.2 |
182290 |
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SÃndrome de Potocki-Lupski |
17p11.2 |
610883 |
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SÃndrome de microdeleção da Neurofibromatose tipo 1 (NF1) |
17p11.2 |
613675 |
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SÃndrome de Koolen-deVries |
17q21.31 |
610443 |
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SÃndrome de microduplicação 17q21.31 |
17q21.31 |
613533 |
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SÃndrome de DiGeorge |
22q11.21 |
188400 |
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SÃndrome de microduplicação 22q11.2 |
22q11.2 |
608363 |
|
SÃndrome de deleção distal 22q11.2 |
22q11.2 |
611867 |
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SÃndrome de Phelan-McDermid |
22q13 |
606232 |
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SÃndrome de Rett |
Xq28 |
312750 |
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SÃndrome de duplicação MECP2 |
Xq28 |
300260 |
*O gene SIN3A, que foi descrito como o gene crÃtico na sÃndrome deWitteveen-Kolk, não é coberto pelas sondas neste teste
Este teste serve para triagem das microdeleções mais frequentes. Variantes não cobertas pelos intervalos da sonda podem não ser detectadas por este método.
| Exigência | Descrição |
|---|---|
| Materiais |
ou
ou
|
| Conservantes | EDTA |
| Volume Recomendável | Sangue: 4ml Saliva: mÃnimo de 1,5 a 2mL |
| Tempo de Jejum | Jejum não obrigatório |
| Conservação |
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| Critérios de Rejeição |
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| Documentos Obrigatórios | Termo de Consentimento |
A metodologia usada no exame é MLPA.
O DNA é extraÃdo de sangue periférico ou saliva de forma automatizada (QIASymphony). Para análise do número de cópias é utilizada a técnica de MLPA (kits MRC-Holland), onde os exons dos genes são hibridizados e amplificados por PCR com sondas fluorescentes especÃficas e o produto resultante é submetido a análise de fragmento em um sequenciador automático ABI 3500.
Este teste não detecta variantes pontuais e pequenas deleções ou duplicações em regiões exonicas, promotoras, intronicas e outros genes não analisados. Adicionalmente, este teste não detecta outras alterações estruturais como translocações e inversões e não detecta grandes deleções e duplicações localizadas nos intervalos entre as sondas. A variação genômica normal na amostra do paciente pode interferir na ligação de sondas.