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Neste exame é realizado o sequenciamento do painel de gene descritos abaixo com análise de número de cópias por bioinformática.
O Painel de Distúrbios Neuromusculares analisa 109 genes associados a distúrbios neuromusculares hereditários, incluindo distrofias musculares, miopatias e sÃndromes congênitas miastênicas. Os distúrbios neuromusculares (NMD) são geneticamente e clinicamente heterogêneos. A idade de inÃcio, a gravidade dos sintomas e os achados histopatológicos são variáveis ??entre diferentes formas de NMD. Os genes neste painel foram curados com base na evidência atual disponÃvel para fornecer um teste abrangente para as causas genéticas da distrofia muscular hereditária, miopatia e sÃndromes miastênicas congênitas.
Dada a sobreposição clÃnica entre diferentes tipos de distrofia muscular, miopatias e sÃndromes miastênicas congênitas, testes abrangentes permitem uma avaliação mais eficiente para várias condições com base em uma única indicação para o teste. A identificação da base molecular da doença pode ser útil para confirmar um diagnóstico, prever o curso da doença e informar o risco de recorrência.
| Exigência | Descrição |
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| Materiais |
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| Conservantes |
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| Volume Recomendável | 8 a 12 ml |
| Tempo de Jejum | Jejum não obrigatório |
| Conservação |
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| Critérios de Rejeição |
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| Documentos Obrigatórios | Termo de Consentimento |
A metodologia usada no exame é Sequenciamento de segunda geração com análise de número de cópias.
O DNA extraÃdo é enriquecido para as regiões-alvo do teste utilizando um protocolo baseado em hibridização e sequenciado em plataforma Illumina. Para atingir uma cobertura >99% em todas as regiões gênicas de interesse, o DNA pode ser sequenciado por duas ou mais técnicas complementares adicionais. O resultado final é uma cobertura de >99% das bases nas regiões exônicas, 10bp de região intrônica adjacente e outras regiões especÃficas conhecidamente causadoras de fenótipos clÃnicos relevantes no momento do desenho do ensaio. A chamada de variante é feita através do transcrito de referência a partir da base A do códon de iniciação ATG alinhado contra o genoma de referência GRCh37. As deleções e duplicações exônicas são chamadas usando um algoritmo "in-house" que determina o número de cópias em cada alvo. Todas as variantes clinicamente significantes são confirmadas por metodologias alternativas, exceto variantes validadas individualmente e variantes previamente confirmadas em um parente de primeiro grau. As metodologias de confirmação incluem qualquer uma das seguintes: sequenciamento Sanger, sequenciamento Pacific Biosciences SMRT, MLPA, MLPA-seq, Array CGH. Regiões promotoras, regiões não traduzidas e outras regiões não codificantes não são avaliadas, senão no contexto anteriomente citado.
Este ensaio atinge >99% de sensibilidade e especificidade para SNVs (single nucleotide variants) e inserções e deleções <15bp (indels), com base nos resultados de validação. A sensibilidade para detectar inserções e deleções maiores que 15bp, porém menores que um exon completo, pode ser reduzida. A análise de deleções/duplicações determina o número de cópias com alta confiabilidade (>95% dos exons direcionados). Esta metodologia pode não detectar mosaicismo de baixo nÃvel. Este laudo reflete a análise de uma amostra de DNA genômico extraÃdo. Em casos raros (neoplasia hematolinfóide circulante, transplante de medula óssea, transfusão de sangue recente) o DNAanalisado pode não representar o genoma constitucional do paciente.
