A doença de Fabry (FD) é um transtorno progressivo, hereditário, multissistêmico do metabolismo dos glicoesfingolipídeos que classicamente afeta os homens hemizigotos sem atividade residual de alfa-galactosidase A e é caracterizada por sintomas neurológicos, cutâneos, renais, cardiovasculares, cerebrovasculares e cocleovestibulares. A FD é pan-étnica e a prevalência varia entre 1 e 5 de cada 100.000, mas a verdadeira prevalência pode estar subestimada. Os sintomas clínicos geralmente surgem na infância, geralmente entre as idades de 4 a 10 anos. As mulheres heterozigotas apresentam frequentemente os sintomas, mas a gravidade varia, desde muito leves até graves. A FD é causada por mutações no gene GLA (cromossomo Xq22) e é transmitida de forma ligada ao cromossomo X.

Neste exame é sequenciado todos os exons do gene GLA

A metodologia usada no exame é Sequenciamento de Segunda Geração (NGS) por Captura.

O DNA extraído é submetido a sequenciamento de segunda geração na plataforma Illumina, após enriquecimento por um método de captura. Os dados são processados para chamada de variantes (SNVs, pequenas indels) no Pipeline Haoma.

A cobertura média esperada é de acima de 99% das bases com profundidade acima de 10x nos exons e 5pb de região intrônica adjacente, além de outras regiões não-codificantes específicas conhecidamente causadoras de fenótipos clínicos relevantes até o momento do desenho do ensaio. Genes com cobertura inferior a 98% são devidamente informados na seção de genes analisados. A numeração da variante é feita através do transcrito de referência a partir da base A do códon de iniciação ATG alinhado contra o genoma de referência GRCh37/hg19. A classificação de variantes é feita de acordo com os critérios do Colégio Americano de Genômica e Genética Clínica (ACMG). 

Este teste detecta >99% das variantes SNVs e de pequenas deleções e duplicações com até 20bp. Variantes maiores que 20bp e menores do que um éxon podem ser detectadas com sensibilidade reduzida. Variantes podem não ser relatadas caso estejam presentes em regiões gênicas não sequenciadas adequadamente, regiões ricas em repetições, regiões intrônicas profundas e áreas com pseudogenes.

• Doença de Fabry
• Gene GLA