O gene PLA2G6 codifica a proteína Fosfolipase A2, responsável pelo metabolismo dos fosfolipídios e manutenção das membranas celulares; além de participar do fluxo de ions através da membrana. Alterações nesse gene foram associadas a desordens neurológicas com acúmulo de ferro, que caracterizam um fenótipo de neurodegeneração associada à PLA2G6:

1. Distrofia Neuroaxonal Infantil (INAD), também chamada de Síndrome de Seitelberger, é uma desordem neurológica e progressiva que leva a deficiência intelectual e motora. O início dos sintomas ocorre entre os seis meses e três ano de vida com hipotonia, tetraparesia espástica progressiva e prejuízos oftalmológicos.

2. Distrofia Neuroaxonal atípica (NAD) apresenta fenótipo mais variado que a INAD. Sua manifestação pode iniciar do final da infância até ao final da secunda década de vida. Os primeiros sintomas são a instabilidade ao caminhar e ataxia. São observados também distúrbios neuropsiquiátricos, tais como impulsividade, perda de atenção, hiperatividade e variações de humor; além dos prejuízos oftalmológicos. A doença mantém curso estável, evoluindo anos depois para encefalopatia.

3. Parkinsonismo-distonia associada a PLA2G6, que afeta indivíduos de várias idades, mas predominantemente adultos jovens com distúrbios de marcha ou alterações neuropsiquiátricas. Os indivíduos afetados desenvolvem distonia e Parkinsonismo, que pode ser acompanhado de declínio cognitivo.

A metodologia usada no exame é Sequenciamento de Segunda Geração (NGS) por Captura.

O DNA extraído é submetido a sequenciamento de segunda geração na plataforma Illumina, após enriquecimento por um método de captura. Os dados são processados para chamada de variantes (SNVs, pequenas indels) no Pipeline Haoma.

A cobertura média esperada é de acima de 99% das bases com profundidade acima de 10x nos exons e 5pb de região intrônica adjacente, além de outras regiões não-codificantes específicas conhecidamente causadoras de fenótipos clínicos relevantes até o momento do desenho do ensaio. Genes com cobertura inferior a 98% são devidamente informados na seção de genes analisados. A numeração da variante é feita através do transcrito de referência a partir da base A do códon de iniciação ATG alinhado contra o genoma de referência GRCh37/hg19. A classificação de variantes é feita de acordo com os critérios do Colégio Americano de Genômica e Genética Clínica (ACMG). 

Este teste detecta >99% das variantes SNVs e de pequenas deleções e duplicações com até 20bp. Variantes maiores que 20bp e menores do que um éxon podem ser detectadas com sensibilidade reduzida. Variantes podem não ser relatadas caso estejam presentes em regiões gênicas não sequenciadas adequadamente, regiões ricas em repetições, regiões intrônicas profundas e áreas com pseudogenes.

• Distrofia Neuroaxonal atípica
• Distrofia Neuroaxonal Infantil
• Gene PLA2G6
• INAD
• NAD
• Neurodegenerescência com acumulação cerebral de ferro tipo 2A/2B
• Parkinsonismo-distonia associada a PLA2G6
• Síndrome de Seiltelberger