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SEQUENCIAMENTO DO GENOMA MITOCONDRIAL - [710174]

Prazo de Entrega - 70 dias corridos
Necessário Agendamento
Descrição do Exame

Esse teste sequencia completamente o genoma mitocondrial. Genes nucleares que afetam a função mitocondrial não são sequenciados.

Mutações genéticas no genoma mitocondrial, ou genes nucleares que codificam proteínas que mantêm as funções das mitocôndrias, podem causar doenças mitocondriais, que afetam 1 em cada 5000-8500 pessoas.

Instruções
Exigência Descrição
Materiais
  • Sangue Periférico
Conservantes
  • EDTA
Volume Recomendável 2 a 8 ml
Tempo de Jejum Jejum não obrigatório
Conservação
  • Enviar a amostra em tubo primário, sem manipulação, refrigerada (2°C a 8°C).
  • A amostra deve chegar ao laboratório Haoma no prazo máximo de 96h após coleta.
Critérios de Rejeição
  • Amostra congelada
  • Presença de coágulo ou hemolisado
  • Amostra coletada por mais de 96 horas
  • Quantidade de amostra insuficiente
  • Avarias no tubo e/ou recipiente do material enviado
  • Tubo com outros anticoagulantes ou conservante inadequado (ex.: HEPARINA)
  • Amostras sem identificação
  • Sem requisição do médico
Documentos Obrigatórios Termo de Consentimento
Metodologia

A metodologia usada no exame é NGS- Sequenciamento de Segunda Geração.

O DNA é extraído de sangue periférico ou saliva de forma automatizada (QIASymphony). Para atingir uma cobertura de >97.5% das bases acima de 10x de profundidade em todas as regiões gênicas de interesse, o DNA é sequenciado pela técnica de captura utilizando-se um kit específico para a região de interesse. A biblioteca é submetida a sequenciamento de segunda geração. As leituras paired-end de 150bp são alinhadas contra o genoma de referência UCSC (hg19) e processadas em pipeline de bioinformática. Quando variantes patogênicas são encontradas, os achados são confirmados por sequenciamento Sanger em um sequenciador automático ABI 3500.

Limitações do exame

- Este teste detecta pequenas deleções e duplicações até 17 bp, mas grandes deleções e duplicações não são detectadas por esta metodologia. Outras alterações estruturais,como inversões e translocações também não são detectadas. Havendo suspeita de algumas destas alterações, pode-se usar metodologias como array CGH, MLPA, qPCR ou FISH. - Mutações por expansão de repeats de trinucleotídeos não são detectáveis por sequenciamento. - Mutações intrônicas profundas ou em regiões regulatórias, como promotores, não são detectáveis no presente teste. - Alteração epigenéticas não são detectáveis por este teste.

Outros nomes
  • Desordens Mitocondriais
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